Можно ли поставить Fastpanel вместо ISPmanager?

Да, Fastpanel установить можно — выбор панели управления остаётся за вами. Ограничение одно: панель ставится на чистый сервер.

— если на сервере уже стоит другая панель или сервисы настроены и работают вручную, Fastpanel лучше не ставить — панели будут конфликтовать;
— самый простой путь — переустановка ОС на чистую систему и установка панели по инструкции разработчика;
— все текущие данные при переустановке удаляются — заранее сделайте снапшот.